A Comunidade do Bairro São José pertencia a Paróquia Santo Antônio e era atendida pelo Pe. Pergentino Delmagro, que morava no Bairro, tudo era difícil, somente existia o salão que servia como Igreja e centro comunitário.

A partir de fevereiro de 1985, o Pe. Anacleto Zaffari começou a atender as capelas do interior, visando à instalação da paróquia do Bairro São José. A necessidade pastoral foi o critério de bom senso usado para este desmembramento. Quando foi criada a Paróquia Santo Antônio, em junho de 1962, havia 100 famílias morando no Bairro Petrópolis e não existia o Bairro São José. Em 1985, juntos somavam 2.500 famílias e continuavam sendo atendidos por um padre só. A Diocese viu a necessidade de uma nova paróquia.

A instalação aconteceu com a celebração da Eucaristia, no dia 09 de junho de 1985, com a participação de autoridades, diretorias e lideranças da matriz e das comunidades. No mesmo dia foi dada a posse do primeiro Pároco, Pe. Anacleto João Zaffare, padre diocesano de Passo Fundo. Desmembrada da Paróquia Santo Antônio e Nª. Sra. de Fátima, de Passo Fundo. Constituída de três regiões distintas: Bairro São José com duas comunidades; Mato Castelhano com 10 comunidades e Coxilha com 04 comunidades, num total de 16 comunidades. Com o crescimento do Bairro São José, Leonardo Ilha, Coronel Massot, tonou-se necessário a organização de novas comunidades e em 1993 surge à comunidade São Sebastião, Divino Espírito Santo (perto da Universidade) em 1995, Nossa Senhora de Lourdes na gruta em 1995, Nossa Senhora Aparecida no Bairro Leonardo Ilha em 1999, Nossa Senhora Aparecida em Coxilha e em 2003 a Comunidade São Jorge – Loteamento Coronel Massot, Passo Fundo.

Em 1992, com a emancipação dos municípios de Mato Castelhano e Coxilha, as comunidades destas regiões passaram a pertencer a Paróquia São José.

Pe. Anacleto João Zaffare, designado para organizar a nova paróquia, juntamente com o apoio das comunidades e das famílias construiu a Igreja, o Centro Catequético e a Casa Paroquial.